Post de SCIENCE & SOCIETE

La machinerie cellulaire 🏭 Silencieusement (en tous cas à notre échelle), des enzymes viennent ouvrir le double brin d’ADN 🔵 pour fabriquer son homologue cytoplasmique : l’ARN 🟡. La raison ? exporter le message contenu dans le génome pour en lire l’information nécessaire à la fabrication des protéines 🟢. Pour ce faire, une petite machine très élaborée, répondant au nom de ribosome, va se placer délicatement sur le brin d’ARN et glisser sur lui afin de traduire la séquence ribonucléique en enchaînement d’acides aminés, c’est-à-dire en matière protéique. Trois par trois, les bases de l’ARN sont traduites en respectant le code génétique, une sorte de dictionnaire ARN-Protéine. C’est ainsi que la cellule fabrique ces molécules fonctionnelles, celles qui nous structurent, nous maintiennent en équilibre homéostatique et nous font vivre, en un mot, ces molécules qui nous définissent dans notre identité biologique et individuelle. Bonne journée à toutes et tous ⭐️ #science #sciencecommunication #vulgarisation #ADN ARN #proteine

💡Extraction de l' ADN plasmidique : La préparation d'ADN plasmidique à partir de bactéries est l'une des techniques les plus courantes de la biologie moléculaire. Le principe de l'extraction est connu sous le nom de lyse alcaline Cette méthode permet de préparer sélectivement l'ADN du plasmide contenu dans les bactéries, tout en éliminant l'ADN du chromosome bactérien. Le principe de cette méthode consiste à effectuer la lyse des cellules au moyen d'un détergent (dodécyl sulfate de sodium) en présence de soude, à pH 13. À ce pH très alcalin, l'ADN est dénaturé, c’est-à-dire que les deux brins de la double-hélice sont séparés. On neutralise ensuite rapidement la solution, ce qui provoque la renaturation brutale (réappariement des brins du duplex d'ADN). L'ADN chromosomique, très long (~10⁶ paires de base), ne parvient pas à se réapparier complètement et forme des enchevêtrements insolubles. L'ADN plasmidique, court (~10³ paires de base), parvient à se réassocier complètement et reste en solution. On sépare alors les espèces par centrifugation. Les protéines précipitées, sont également éliminées avec le détergent et l'ADN chromosomique. L'ADN plasmidique, resté en solution, est alors concentré par précipitation à l'alcool. Voici les étapes de l' extraction d'ADN plasmidique #génie génétique #biologie moléculaire #ADN plasmidique 🧬🔬

Dans une étude récente publiée dans le journal Plos Pathogens, les chercheurs des unités Virologie et Immunologie Moléculaires – #VIM et Infectiologie Expérimentale des Rongeurs et Poissons - #IERP (INRAE Ile-de-France - Jouy-en-Josas - Antony) apportent un nouveau regard sur l'étude des interactions hôte - pathogène en ayant levé un verrou technologique par l'obtention de la génétique inverse de ce virus et la production de virus recombinants traçables optiquement. 👉 https://url-r.fr/cZMzQ

Une présentation synthétique sur les méthodes de testing dans le cancer bronchique non à petites cellules #CBNPC faite par le Pr #KarenLeroy : - Place des #techniquesciblées de biologie moléculaire ; - Comparaison avec le séquençage génétique #NGS ; - Focus sur le type de séquençage génétique : type de prélèvement, technique basée sur l'ADN ou l'ARN ! https://lnkd.in/e7csKcNb

Extraction de l'ADn plasmidique

#La #différence #entre #la #mutagenèse #aléatoire #et #la #mutagenèse #dirigée: ■Mutagenèse aléatoire: ●Principe: Les mutations sont introduites de manière aléatoire dans le génome, sans cibler une séquence spécifique. ●Agents mutagènes: Les agents mutagènes utilisés sont variés et peuvent être physiques (rayonnements UV, rayons X), chimiques (substances alkylants, analogues de bases) ou biologiques (virus, transposons). ■Mutagenèse dirigée: ●Principe: Les mutations sont introduites à un endroit précis du génome, avec une séquence nucléotidique modifiée de manière spécifique. ●Techniques: Les techniques de mutagenèse dirigée sont nombreuses et en constante évolution, mais elles reposent généralement sur des enzymes de restriction et des ligases pour couper et recoller l'ADN, ainsi que sur des oligonucléotides synthétiques complémentaires de la séquence à modifier. Parmi les techniques les plus utilisées, on peut citer : ☆☆PCR site-dirigée: Elle permet de modifier de petits fragments d'ADN. ☆☆CRISPR-Cas9: Cette technique révolutionnaire permet de modifier l'ADN de manière très précise et efficace..

Le séquençage de l'ADN est une technique puissante qui nous permet de lire l'ordre précis des bases nucléotidiques dans une molécule d'ADN. Cette molécule, souvent appelée le code génétique, contient les instructions nécessaires pour le développement, le fonctionnement et la reproduction de tous les organismes vivants. Le processus de séquençage de l'ADN peut être complexe, mais il repose sur un principe fondamental : la détermination de l'ordre des bases chimiques qui composent l'ADN, à savoir l'adénine (A), la thymine (T), la cytosine (C) et la guanine (G). Plusieurs techniques de séquençage de l'ADN ont été développées au fil des années, mais toutes partagent l'objectif commun de déchiffrer l'information génétique codée dans l'ADN. En comprenant les principes du séquençage de l'ADN, nous sommes en mesure de réaliser des avancées majeures dans de nombreux domaines, tels que la médecine, l'agriculture, la biologie évolutive et la biotechnologie. #ADN #SéquençageADN #CodeGénétique #BasesNucléotidiques #CBW

J'ai déjà fait plus de 1500 électrophorèses à la date d'aujourd'hui. 🧑🔬 L'électrophorèse est une méthode utilisée en biologie moléculaire pour séparer et analyser les molécules, comme l’ADN, l’ARN ou les protéines, en fonction de leur taille et de leur charge électrique. Elle sert à : Vérifier la présence ou non d'ADN/ARN Identifier des fragments d’ADN ou d’ARN après une PCR Analyser les profils protéiques pour des études biologiques ou médicales Étudier les variations génétiques du vivant à partir des profils d'électrophorèse L'électrophorèse fait partie des plus grandes compétences que je dispose en biologie moléculaire. J'ai utilisé cette technique avec succès pour des analyses sur les plantes, les micro-organismes, et actuellement, au sein de mon organisation Blood Health Unit-BHU, nous réalisons des tests d’électrophorèse de l’hémoglobine qui permettent de savoir son état par la rapport à la maladie de drépanocytose, Sain, Porteur sain ou Malade (AA, AS, SS). Pour plus d'informations, contactez-moi au +229 67046372.

🔬 Exploration du spectre d’hôte des bactériophages et détection des récepteurs bactériens ! 🦠 Je suis très heureuse de partager les résultats d'un projet académique récent, où nous avons étudié l’interaction entre les phages (Psonyx, Cyrano PS, et Jean Grey) et la bactérie Corynebacterium glutamicum. 🚀 💡 Objectifs du projet : - Identifier les souches bactériennes susceptibles d’être infectées par ces phages (détermination du spectre d'hôte). - Détecter les récepteurs bactériens potentiels, en particulier via le clonage du gène codant pour l'endolysine du phage Psonyx. Nous avons utilisé des méthodes comme la PCR pour amplifier l’ADN, suivi de techniques d’électrophorèse sur gel d’agarose pour valider cette amplification. Malgré certains défis rencontrés, notamment lors de l’insertion de l’ADN dans des cellules compétentes, cette expérience nous a permis d’obtenir des données précieuses sur la capacité d’infection des phages et l'importance de certains récepteurs bactériens. Résultats clés : - Certaines mutations bactériennes semblent affecter la capacité des phages à reconnaître et infecter leurs hôtes.  - L’analyse des plages de lyse dans les tests de titrage en spot a montré des différences significatives entre les mutants et les souches témoins (ex. Corynebacterium glutamicum ATCC13032), nous aidant à identifier des récepteurs bactériens essentiels. 👉 Perspectives: Avec plus de temps, nous aurions pu affiner nos techniques de clonage pour mieux comprendre l'influence de l'endolysine et approfondir nos études sur l'adaptation des phages à différents mutants. Ce projet a été une belle découverte pour nous physiciens et une grande avancée dans la compréhension des interactions phage-bactérie. Il pourrait offrir des perspectives passionnantes pour la biotechnologie et le développement de nouveaux outils antimicrobiens.  L'électrophorèse sur gel d'agarose(image ci-dessous) montre une bande d'ADN amplifiée correspondant au gène de l'endolysine. Cette étape critique met en évidence le succès de la PCR et constitue un pas important vers l'identification des récepteurs potentiels du phage Psonyx. 🎯 #Recherche #Biotechnologie #Bactériophages #Microbiologie #Biophysique #PCR #Clonage #PhageTherapy

"Pourquoi est-il important de cloner des gènes ? Imaginez qu'un gène animal a été obtenu sous la forme d'un fragment de restriction unique après digestion d'une molécule plus grande avec l'enzyme de restriction BamHI, qui laisse des extrémités collantes 5´–GATC–3´. Imaginez également qu'un plasmide – un petit cercle d'ADN capable de se répliquer à l'intérieur d'une bactérie – a été purifié à partir d'E. coli et traité avec BamHI, qui coupe le plasmide en un seul endroit. Le plasmide circulaire a donc été converti en une molécule linéaire, encore une fois avec des extrémités collantes 5´–GATC–3´. Mélangez les deux molécules d'ADN ensemble et ajoutez de la ligase d'ADN. Divers produits de ligation recombinants seront obtenus, dont l'un comprend le plasmide circularisé avec le gène animal inséré à la place initialement occupée par le site de restriction BamHI. Si le plasmide recombinant est maintenant réintroduit dans E. coli, et que le gène inséré n'a pas perturbé sa capacité réplicative, alors le plasmide plus le gène inséré seront répliqués et des copies seront transmises aux bactéries filles après la division cellulaire. Le plasmide agit donc comme un vecteur de clonage, fournissant la capacité réplicative qui permet de propager le gène cloné à l'intérieur de la cellule hôte. Plusieurs cycles de réplication du plasmide et de division cellulaire donneront lieu à une colonie de bactéries E. coli recombinantes, chaque bactérie contenant de multiples copies du gène animal. Cette série d'événements constitue le processus appelé clonage d'ADN ou de gènes." _un article transmis _