Ce memoire sur les mecanismes de la desorption/ionisation laser assistee par matrice (MALDI) est le fruit de travaux realises au laboratoire de spectrometrie de masse et de chimie laser (LSMCL) de l'universite de Metz. Cette thematique est apparue au laboratoire suite au developpement de l'analyse des biomolecules par spectrometrie de masse et a l'experience accumulee depuis 15 ans sur la desorption laser. Nous nous sommes attaches a decomposer les etapes constituant une analyse MALDI afin de mieux comprendre les mecanismes mis en jeu lors de ce type d'ionisation. Nous avons plus precisement, a l'aide de molecules modeles (nucleotides, peptides,), etudie l'interaction entre le faisceau laser et les matrices couramment utilisees. Ceci nous a permis de mettre en evidence le role important des petites molecules neutres (notamment le dioxyde de carbone) qui sont ejectees lors de l'expansion du nuage gazeux induit par irradiation laser. Dans ce contexte, nous avons etudie des derives et des complexes de la cyclodextrine. Cette partie nous a permis d'expliquer les phenomenes d'interaction entre la molecule cible et les molecules de matrice ainsi que l'influence de la longueur d'onde du laser ionisant. A l'aide de la technique MALDI, nous avons pu mettre en evidence des differences structurales et caracteriser des complexes d'inclusion intacts. (auteur)