Vēsturiski Hantingdonšīra bijusi patstāvīga grāfiste, kuras robežas iedibinātas jau sakšu laikos. Iekļaujot 1154. gadā grāfisti Anglijas sastāvā, Henrijs II visu Hantingdonšīru noteica par karalisko mežu. 1889. gadā Hantinggdonšīra kļuva par administratīvo grāfisti. 1965. gadā, apvienojot ar Pīterboro soku, tika izveidota Hantingdonas un Pīterboro grāfiste. 1974. gada 1. aprīlī Hantingdonas un Pīterboro grāfisti apvienoja ar Kembridžšīras un Īli salas grāfisti, izveidojot mūsdienu Kembridžšīras ceremoniālo grāfisti. Hantingdonšīra, izņemot Oldfletonas distriktu, ko pievienoja Pīterboro distriktam, kļuva par patstāvīgu distriktu Kembridžšīras sastāvā.