Principales mutaciones en proteína Spike dentro de transmisión humano-humano y con vectores de zoonosis.
Muy buenos días, mi nombre es David Martínez Gil
El día de hoy hablaremos de actualizaciones en mutaciones para SARS-CoV-2
Las mutaciones que surgen en el SARS-CoV-2 aumentan en la transmisión sostenida de persona a persona y el paso de persona a animal conocido como zoonosis.
La proteína (S) de SARS-CoV-2 posee dos subunidades (S1 y S2). La subunidad S1 es la que interacciona y se une al receptor ACE2 por medio del dominio de unión al receptor (RBD), mientras que, la subunidad S2 determina la fusión de la membrana del virus con la de la célula huésped (Yan-Rong et al.; Hao et al.). Para que el virus complete la entrada en la célula hospedera, la proteína (S) debe ser cortada o modificada por una enzima proteasa (TMPRRS2). La alteración en la proteína (S) ocurre en 2 diferentes posiciones de la subunidad S2, esto contribuye a la separación de la unión RBD de la subunidad S1 con el receptor ACE2 y a la posterior fusión de las membranas, facilitándose así, la entrada del virus mediante endocitosis a la célula blanco (Ali et al.; Mousavizadeh & Ghasemi).
Las principales modificaciones o mutaciones al sitio de unión y a las interacciones de la proteína S con el receptor ACE2 contribuye a la mayor actividad del virus y a una capacidad evolutiva para poder colonizar al huésped.
Principales compilación de mutaciones en las proteínas S de SARS-CoV-2 que ocurren en humanos y animales. Esferas rojas: variante del Reino Unido (UK), Esferas azules: variante sudafricana (ZA), Magenta: ambas variantes UK / ZA, Esferas amarillas: animales como se indica en el recuadro. NTD: dominio amino-terminal. RBD: dominio de unión al receptor.
Las distintas interacciones entre humanos o entre especies favorecen la propagación viral y la capacidad de mutación en el sitio de unión lo que conlleva a una mayor estereoespecificidad y una capacidad mayor de anclaje al receptor.
La respuesta inmune innata para montar una respuesta antiviral del sistema inmune innato, detecta una infección mediante receptores de reconocimiento de patrones (PRRs), es decir, receptores que identifican moléculas intrínsecas presentes en los patógenos. Estas moléculas intrínsecas corresponden a los patrones moleculares asociados a patógenos (PAMPs) parte de los efectos que se han tipificado con relación a las diversas mutaciones en la proteína S confieren una capacidad limitada de reconocimiento (PRRs) lo que retrasa la respuesta inmune primaria.
Entre las proteínas virales S que llevan mutaciones representativas que surgen en el paso de persona a persona y de persona a animal incluyen:
hCoV-19 / SouthAfrica / Tygerberg-461/2020 | EPI_ISL_745186 | 2020-12-07
hCoV-19 / England / LOND- 1267020/2020 | EPI_ISL_741243 | 2020-12-11
hCoV-19 / mouse / Harbin / HRB-26m / 2020 | EPI_ISL_459910 | 2020-04-19
hCoV-19 / mink / Países Bajos / 1/2020 | EPI_ISL_431778 | 2020-04- 24
hCoV-19 / mink / Holanda / NB01_02KS / 2020 | EPI_ISL_447624 | 2020-04-29
hCoV-19 / mink / Holanda / NB02_07KS / 2020 | EPI_ISL_447629 | 2020-04-29
hCoV-19 / mink / Holanda / NB02_16RS / 2020 | EPI_ISL_447632 | 2020-04-28
hCoV-19 / cat / France / Env-Ba / 2020 | EPI_ISL_483063 | 2020-05-14
hCoV-19 / cat / France / Env-Di / 2020 | EPI_ISL_483064 | 2020-05-14
hCoV-19 / cat / Bélgica / BE-MG-0320/2020 | EPI_ISL_487275 | 2020-03-11
hCoV-19 / cat / Dinamarca / mDK-315/2020 | EPI_ISL_683164 | 2020-11-17
hCoV-19 / cat / EE. UU. / TX-TAMU-013/2020 | EPI_ISL_699506 | 2020-06-28
hCoV-19 / cat / EE. UU. / TX-TAMU-057/2020 | EPI_ISL_699507 | 2020-07-17
hCoV-19 / cat / EE. UU. / TX- TAMU-078/2020 | EPI_ISL_699509 | 2020-07-29
hCoV-19 / cat / Greece / 2K / 2020 | EPI_ISL_717979 | 2020-11-23
hCoV-19 / lion / USA / NY-3-041520 / 2020 | EPI_ISL_566037 | 2020-04-04
hCoV-19 / lion / USA / NY-041520/2020 | EPI_ISL_566038 | 2020-04-04
hCoV-19 / lion / USA / NY-2/2020 | EPI_ISL_566044 | 2020-04-04
hCoV-19 / tiger / USA / NY-040420/2020 | EPI_ISL_420293 | 2020-04-02
hCoV-19 / dog / HongKong / 20-02756 / 2020 | EPI_ISL_414518 | 2020-02-26
hCoV-19 / dog / USA / TX-TAMU -077/2020 | EPI_ISL_699508 | 2020-07-28
hCoV-19 / perro / Italia / Perro399-20BA / 2020 | EPI_ISL_730652 | 2020-11-04
Es muy importante no perder de vista que las mutaciones generalizadas en un patógeno emergente con capacidad de interacción entre especies como SARS-CoV-2 puede eventualmente producir una variable con mayor grado infeccioso por lo que será muy conveniente evitar el contacto aún con animales domésticos si se detecta que se está cursando por un periodo infeccioso de COVID-19 ya sea asintomático, con síntomas leves a moderados o graves.