France Génomique

I am very happy to share our latest development, the first proof-of-concept on the multiplexed analysis of microRNAs by digital PCR, just published in open access in Analytica Chimica Acta with Florence Busato as lead author in collaboration with Stilla Technologies. This development constitutes an important step in our efforts translating miRNA signatures into routine use for clinical diagnostic and personalized patient management.    #digitalPCR #Personalizedmedicine #microRNA #StillaTechnologies

Une partie de l'équipe a participé aux journées WetLab de France Génomique. Olivier a présenté les premiers résultats prometteurs de nos séquenceurs Aviti Element Biosciences 🚀 Camille Marcuzzo et Carina ont mis en avant les outils de paillasse que nous allons déployer pour faciliter la réalisation de vos projets 💡 C'était un vrai plaisir d'échanger et de partager notre expérience avec les autres plateformes de France Génomique. Nous avons hâte de voir où tout cela va nous mener! Suivez nous pour le savoir get@genotoul.fr

New insights into chronic myelomonocytic leukemia: Combining short & long-read RNA sequencing with k-mer analysis unveils 4 chimeric RNAs. These results could help advance patient risk stratification & treatment! We collaborated with @IRMB and the CNRGH from the @CEA by constructing the libraries and performing @nanopore sequencing from human samples.New insights into chronic myelomonocytic leukemia: Combining short & long-read RNA sequencing with k-mer analysis unveils 4 chimeric RNAs. These results could help advance patient risk stratification & treatment! We collaborated with @IRMB and the CNRGH from the @CEA by constructing the libraries and performing @nanopore sequencing from human samples.

60 new genomes of brown algae analysed (France Génomique Project “Phaeoexplorer”) An international team of researchers, led by the CNRS and the CEA and funded by France Génomique, analyzed 60 new genomes of brown algae, an essential group of marine ecosystems. Published in Cell (https://lnkd.in/eUCSPH9z), this study reveals key genomic innovations that have enabled the adaptation of brown algae to coastal environments subject to tides. These advances shed new light on the evolution of these “underwater forests” which play a crucial role in carbon sequestration and the resilience of coastal ecosystems.

📣 Happy to announce a new edition of our Symposium on Human Genomics: ISHG2025! 📅 5-6-7 May 2025 📍 Travel grants available for early career scientists! ➡ More infos: https://lnkd.in/ezGvYVSr Please share!

Excited to announce that our QC tool for Oxford Nanopore Technologies sequencers #ToulligQC is now available as an EPI2ME-compatible workflow! 🎉🎉 The EPI2ME Desktop application is easy to use and allows users of any skill level to run their bioinformatic analyses! Go check it out on our github https://lnkd.in/eQPQbmST and EPI2ME Labs https://lnkd.in/e26Bq44A

📢 Voici les nouvelles arrivées sur la plateforme GeT PlaGe : 3 séquenceurs Aviti de Element Biosciences sont maintenant installés et en cours de validation. Leurs missions : - continuer de vous accompagner dans vos projets short-reads ( reséquencage, transcriptomique, EM-seq, Hi-C, métabarcoding 16S, sparse etc ... ) - permettre une utilisation en autonomie des machines. Nous reviendrons rapidement vers vous pour vous présenter les résultats de nos runs de validation. Et vous pouvez dès à présent nous contacter pour discuter de votre projet futur sur des runs pilotes! 📩 get-place.contact@genotoul.fr

Better together: Scientists from 33 European countries join forces to generate reference genomes for the continent’s rich biodiversity. The European Reference Genome Atlas (ERGA) Pilot Project reports its success in uniting researchers from across Europe to produce high-quality reference genomes for 98 species. With financial help from France Génomique. Press release: https://lnkd.in/eT_ebTCX Link to the collection: https://lnkd.in/gn8VjiUs

📢 Quelque chose de prépare ! Des triplées vont bientôt nous rejoindre et nous sommes impatients de vous les présenter... 👀 A votre avis ? qui sont-elles ? Dans une volonté de toujours vous accompagner au mieux, GeT PlaGe est impatient de discuter de vos futurs projets! 📩 get-plage.contact@genotoul.fr #NGS #Sequencing #Innovation Element Biosciences

📢 2 Job Offers at TGML (Sequencing platform in Marseille). https://lnkd.in/edQb86nZ https://lnkd.in/eaNNNGD9