Após seu retorno à grade de programação, Pequenas Empresas & Grandes Negócios seguiu trabalhando com os mesmos elementos (matérias de serviço, noticiário, agenda semanal e relatos de experiências pessoais dos microempresários), e investiu mais na linguagem visual para encontrar soluções atraentes que prendessem a atenção do telespectador. O programa ganhou vinhetas eletrônicas e um cenário feito com ajuda de computação gráfica.

As reportagens continuaram a apostar na criatividade. Alguns dos temas tratados pelo programa foram: um ateliê especializado em bonecas de pano, cuja venda ajudava crianças excepcionais; o Táxi Cão, um serviço de transporte para pequenos animais; a pesca e o comércio da lagosta no Nordeste; e o limpareia, um adaptador para recipientes de plástico inventado em Belo Horizonte que, ligado ao acendedor do automóvel, transformava-se em um depósito de água para pequenas limpezas.

As entrevistas eram apresentadas nas colunas Opinião – com pessoas que falavam sobre assuntos de interesse dos pequenos empresários – e Palanque Eletrônico – com os representantes dos principais partidos políticos falando do que podiam fazer pelo micro e pequeno empresário. Outros quadros também passaram a fazer parte do programa, como o Literatura dos Negócios – um guia de lançamentos de livros sobre microempresas –, o Vídeo Empresa – exibição de vídeos institucionais enviados à produção do programa – e o Máquinas & Equipamentos, com novidades tecnológicas. Outras seções informativas, posteriormente criadas, foram Classificados, Dicionário dos Negócios e Tempo de Franquia.

Na sua segunda fase, Pequenas Empresas & Grandes Negócios passou a ser dirigido por Celso Fernando e supervisionado por Nelson Gomes, que assumiu a direção do programa em 1993. A editora responsável era Carmensita Corso, a coordenação geral estava a cargo de Maria Helena Tornovski e na produção estavam Alice Rondon e Oswaldo Delessio Filho.