在戰鬥中零號機遭到使徒侵蝕，真嗣緊急駕初號機出擊救援。
但最終零選擇將機體自爆，與使徒同歸於盡。
陷入消沉的真嗣這時卻接獲美里的通知，告訴他零還活著。
而此事卻也揭開了律子心中的黑暗面，以及關於「綾波零」這個生命的重大秘密！
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