在少子化衝擊下，大專院校招生情況也日益嚴，在今年各校系註冊率，共有67科系註冊率不到3成，在這些低註冊率的科系中又有4系註冊人數直接掛零。不只如此，許多頂尖大學的博士班也開始出現招不到人的窘境，以台大為例，104年度農業經濟學系、生命科學系、戲劇系、海洋所等4個博士班註冊率都掛零。

蘋果報導，教育部統計，今年大專校院五專部至大學部學制，共有67科系註冊率未滿3成，註冊率3成至4成的有52科系，4成至5成的有89科系。若只算四年制大學部份，則有44科系註冊率不及3成，其中一般大學有5校8系，技職校院則有13校36系，註冊率未達3成；和春技術學院有15科系註冊率不到3成，是各校最多。

今年註冊率掛零的4科系，包括國立高雄海洋科大微電子工程系（二技）、中洲科技大學電子工程系（四技）、台北海洋技術學院二專部數位遊戲與動畫設計科以及海洋休閒觀光科。由於明年大學新鮮人將減少3萬人，大學招生問題將日益嚴峻，教育部也訂出大學退場指標，其中包括連續2年全校平均註冊率未達6成；不過教育部今公布的相關數據中，只有科系註冊率、沒有全校平均數據。

中時報導，教育部長吳思華上午表示，會針對註冊率較差的學校，由高教評鑑中心抽查教學品質，抽查重點是確保教學品質，包括避免過度併班上課，以及改變原有的教學內容。另外，財務狀況也是一大重點，對於有危機的學校，不排除強制信託，並派公益監察人到校監督。

吳思華強調，他也希望未來朝向更公開透明的方向，目前「創新轉型條例」賦予一些法律授權，希望立法院下個會期能通過，趕在5月放榜前公開相關資訊。

中央社報導，值得注意的是，104年度許多「邁向頂尖大學計畫」的學校，博士班招生狀況慘澹甚至掛零，就連台大也有4個博士班的註冊率都掛零。其他「邁頂」成員大學，也都有註冊率掛零的博士班，例如政治大學社會系、外交系、會計系、財務管理系等4個博士班；清華大學先進光源科技博士學位學程、統計所博士班；交通大學統計所博士班、網路與資訊系統博士學位學程。

不只如此，知名大學包括成功大學5個博士班、中興大學3個博士班、中央大學8個博士班、中山大學3個博士班、陽明大學2個博士班，註冊率都是零。

自由報導，對此，台大教務長莊榮輝表示「還好只有4所。」因博士班招生這幾年都有下降，主要是大環境少子化影響，假設博士班畢業出來就業、就職都很有出路，那大家念的意願就高。但少子化下大學教職變少，大學數目無法維持，學生念博士的意願自然受影響，是供需失衡問題；目前教育部已要求各校減少碩博班固定名額，台大也會進行配套措施讓博班人數下降。

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